TogoDX/Humanの使い方

目次


動画マニュアル

'TogoDX/human を使ってヒトのデータベースを統合的に探索、俯瞰、抽出する'

画面構成

Explorer画面

Explorer

Explorer画面(トップページ)では、遺伝子・タンパク質・化合物・疾患など各カテゴリごとに、様々な属性の内訳を俯瞰的に表示したり、絞り込み条件を指定することができます。また、ユーザが持つIDのリストを指定することで、各属性における分布を簡易的なエンリッチメント解析のように表示させることができます。

属性詳細

Explore

各属性の>ボタンで、詳細データを展開表示することができます。

階層分類を持つ属性では細分類ごとの内訳が表示されます。

Results画面

result

絞り込み条件に合致するSelect target datasetで指定したIDの一覧、または、Map your IDsで指定したIDに対応する結果の一覧と、Add filtersの値およびMap attributesの内訳が取得できます。画面上部には検索結果の分布の内訳グラフが表示されます。検索結果に含まれる各IDからは、より詳細な情報をポップアップ表示することができます。検索結果はSaved conditionsからダウンロードすることができます。

result_stanza

操作方法

Add filtersを用いた探索方法

Add filtersでは、様々な属性における絞り込み条件を満たすIDセットを取得します。

Map Attributesを用いた探索方法

Map attributesではAdd filtersMap your IDsで絞り込まれたIDセットに対し、他の属性での分布を見ることで新たな発見を促します。

Map your IDsを用いた探索方法

Map your IDsでは、手持ちのIDリストに対する各属性での偏りやp値の計算、Add filtersによる絞り込みや、Map attributesによる他の属性での分布を確認することができます。

Map your IDs

Map your IDs

その他

ページヘッダ

初期化

IDのリンク関係

ID relations